ክፍት ምንጭ OCR የቧንቧ መስመር የካንሰር መዝገብ መረጃ መዘግየትን ይቀንሳል

ምን ተፈጠረ

በሚኒሶታ ዩኒቨርሲቲ የሚመራ የምርምር ቡድን ድቅል ክፍት ምንጭ ኦፕቲካል ቁምፊ ማወቂያ (OCR) ቧንቧ መስመር ከተቃኙ Oncotype DX የጡት ካንሰር ሪፖርቶች ውስጥ የጂኖሚክ ድግግሞሽ ውጤቶችን በትክክል ማውጣት እንደሚችል አሳይቷል። በካንሰር መንስኤዎች እና ቁጥጥር ላይ የታተመው ጥናቱ የTesseract እና EasyOCR ሞተሮችን በማጣመር 675 ሪፖርቶችን በማዘጋጀት 97% በእጅ የሰው ልጅ ረቂቅነት ስምምነት ላይ ደርሷል። አውቶሜትድ ስርዓቱ ከ12 እስከ 18 ወራት መዘግየቶች ከሚገጥመው ባህላዊ በእጅ መዝገብ የመግባት ፍጥነት በእጅጉ የላቀ ነበር።

ኪያዩን ሉኦ እና ሼሎሞ ማርሞርን ጨምሮ የምርምር ቡድኑ በካንሰር መዝገብ ቤቶች ውስጥ ያለውን መዘግየት ለመቅረፍ 'ድብልቅ OCR' (H-OCR) ቧንቧ ዘረጋ። እንደ Oncotype DX የተደጋጋሚነት ውጤት ያሉ የጂኖሚክ ምርመራ ውጤቶች በማሽን ሊነበብ ከሚችል መረጃ ይልቅ በኤሌክትሮኒክ የጤና መዛግብት (EHRs) ውስጥ በተደጋጋሚ ይቀመጣሉ።

የH-OCR ቧንቧው EasyOCRን በጥልቅ-ትምህርት ላይ ለተመሰረተው የፅሁፍ ማወቂያ እና Tesseractን ለገጸ ባህሪ እውቅና እንደ የኋላ ሞተር ይጠቀማል። ይህ ዲቃላ አካሄድ የTesseractን ፍጥነት እና የገጸ ባህሪን የመለየት ችሎታዎች በሚጠቀሙበት ወቅት በሪፖርቶች ላይ ክብ ማብራሪያዎችን የማውጣት የ EasyOCR ችሎታን ለመጠቀም ታስቦ ነው።

በ675 ሪፖርቶች የማረጋገጫ ስብስብ ውስጥ፣ የH-OCR ቧንቧ መስመር በእጅ የማጣቀሻ ደረጃዎች 97% ስምምነትን አግኝቷል፣ ይህም ከተለመደው የመመዝገቢያ ረቂቅ 91% ትክክለኛነትን የላቀ ነው። አሁን ካለው በእጅ የሚሰሩ የስራ ፍሰቶች ከተለመዱት የወራት መዘግየቶች ጋር ሲነፃፀር የአውቶሜትድ ሂደቱ ስራውን በግምት በ4.9 ሰአታት ውስጥ አጠናቋል።

ጥናቱ እንደሚያሳየው የቧንቧው በራስ መተማመን ውጤቶች ሊከሰቱ የሚችሉ ስህተቶችን ውጤታማ በሆነ መንገድ ለይተው ያውቃሉ፣ ይህም ወደፊት ትግበራዎች እነዚህን ውጤቶች ተጠቅመው እርግጠኛ ያልሆኑትን ለሰው ልጅ ግምገማ እንደሚጠቁሙ ይጠቁማል።

የምንጭ ዝርዝሮች: bioengineer.org ↗

ለምን አስፈላጊ ነው።

ለጂኖሚክ መረጃ በእጅ ወደ ጽሑፍ ቅጂ አሁን ያለው ጥገኛ በካንሰር ምርምር እና ትክክለኛ ኦንኮሎጂ ላይ ትልቅ ማነቆ ይፈጥራል። የተዋቀሩ መረጃዎችን ካልተዋቀሩ ፒዲኤፍዎች በራስ ሰር በማውጣት፣ ይህ ክፍት ምንጭ አቀራረብ የጤና ስርዓቶች በእውነተኛ ጊዜ የካንሰር መዝገብ ቤቶችን እንዲሞሉ ያስችላቸዋል። ይህ ለውጥ የገሃዱ ዓለም ማስረጃዎችን ጥራት ለማሻሻል፣ ፈጣን የንጽጽር ውጤታማነት ምርምርን ለማስቻል እና የወደፊት AI ሞዴሎችን በኦንኮሎጂ ለማሰልጠን አስፈላጊ የሆነውን የተዋቀረ መረጃ ለማቅረብ ወሳኝ ነው። መሳሪያዎቹ ክፍት-ምንጭ በመሆናቸው እና በ HIPAA-ተሟጋች አካባቢዎች ውስጥ ሊሰሩ ስለሚችሉ, ይህ ዘዴ ዝቅተኛ ወጭ እና እንደገና ሊባዛ የሚችል መፍትሄ በንብረት ለተገደቡ ተቋማት የውሂብ መሠረተ ልማቶቻቸውን ያለባለቤትነት ሶፍትዌር ለማዘመን ያቀርባል.

ጂኖሚክ ባዮማርከርስ ለትክክለኛ ኦንኮሎጂ እና የጥራት መለኪያ አስፈላጊ ናቸው፣ነገር ግን የእነርሱ ጥቅም በአሁኑ ጊዜ በምርምር ዳታቤዝ ውስጥ እንዲገኙ ለማድረግ በሚወስደው ጊዜ የተገደበ ነው። ይህንን መዘግየት መቀነስ የበለጠ ወቅታዊ ማስረጃን ለመፍጠር ያስችላል።

እንደ Tesseract እና EasyOCR ያሉ የክፍት ምንጭ መሳሪያዎችን መጠቀም መፍትሄው ውድ ለሆኑ እና የባለቤትነት የህክምና መረጃ ማውጣት ሶፍትዌር በጀት ሊጎድላቸው ለሚችሉ ትናንሽ ወይም በንብረት ለተገደቡ የካንሰር ማእከላት ተደራሽ መሆኑን ያረጋግጣል።

ጥናቱ እንደሚያሳየው የዚህ አውቶሜትድ ቀረጻ ጥቅማጥቅሞች በተለያዩ ታካሚ ህዝቦች ላይ በስፋት ተፈጻሚነት ይኖራቸዋል, ምክንያቱም ተመራማሪዎቹ የታካሚ ስነ-ሕዝብ እና ክሊኒካዊ ሁኔታዎች የማውጣት ስህተቶችን በከፍተኛ ሁኔታ መተንበይ አልቻሉም.

ያልተዋቀሩ ሁለትዮሽ ነገሮችን ወደ የተዋቀረ መረጃ በመቀየር, ይህ የቧንቧ መስመር በኦንኮሎጂ ቦታ ላይ የወደፊት AI እና የማሽን መማሪያ ሞዴሎችን ለማሰልጠን እና ለማጣራት አስፈላጊውን ከፍተኛ ጥራት ያለው ረጅም መረጃ ያቀርባል.

ቀጥሎ ምን እንደሚታይ

የወደፊቱ ጥናት የዚህን ቧንቧ መስመር ከመደበኛው የኦንኮታይፕ ዲኤክስ ቅርፀት በላይ ያለውን ሚዛን ማስተካከል ያስፈልገዋል። በአቅራቢዎች መካከል ከፍተኛ ልዩነትን የሚያሳዩ የሶማቲክ ቀጣይ ትውልድ ተከታታይ ዘገባዎች በራስ ሰር ለማውጣት የበለጠ ውስብስብ ፈተና እንደሚያቀርቡ ደራሲዎቹ ጠቁመዋል። በተጨማሪም፣ ጥናቱ የቧንቧ መስመርን ወደ ኋላ ከተገመገመ የውሂብ ስብስብ አንጻር ሲያረጋግጥ፣ በእውነተኛው ዓለም እና ከፍተኛ መጠን ባለው ቅንጅቶች ውስጥ ያለውን አስተማማኝነት ለማረጋገጥ በቀጥታ ክሊኒካዊ መዝገብ ቤት የስራ ፍሰቶች ውስጥ የወደፊት ሙከራ ያስፈልጋል።

ተመራማሪዎቹ በአቅራቢዎች እና በቅርጸት በከፍተኛ ሁኔታ የሚለያዩ እንደ somatic next-generation sequencing ሪፖርቶች ባሉ የተለያዩ የሰነድ ዓይነቶች ላይ የቧንቧ መስመር መሞከር አስፈላጊ መሆኑን በግልፅ ለይተዋል።

ጥናቱ የተካሄደው በአንድ የጤና ስርዓት ነው; በቀጣይ ስራ የቧንቧ መስመር ዝርጋታ በበርካታ ተቋማት ውስጥ ያለውን አፈጻጸም መገምገም አለበት ከስካን ጥራት፣ የፋክስ መፍታት እና ከተለያዩ የኢኤችአር አወቃቀሮች ልዩነቶች ጋር።

ወደፊት የሚመጣውን ክሊኒካዊ መረጃ በቅጽበት ሲያካሂድ ስርዓቱ ትክክለኝነት እና ቅልጥፍናን የሚጠብቅ ከሆነ በቀጥታ ወደ መዝገብ ቤት የስራ ፍሰቶች መቀላቀል ቀጣዩ ምክንያታዊ እርምጃ ነው።

ተዛማጅ መመሪያዎች እና ጥያቄዎች