行业指南

药物发现中的人工智能

药物发现中的人工智能利用机器学习来预测分子行为、设计新化合物,并缩短寻找可行药物通常所需的时间和数十亿时间。

概述

药物发现中的人工智能利用机器学习来预测分子行为、设计新化合物,并缩短寻找可行药物通常所需的时间和数十亿时间。它正在重塑制药行业最慢、风险最高的部分。

药物发现中的人工智能将人工智能应用于特定领域的环境中,在这些环境中,法规、操作和风险承受能力强烈影响设计选择。

深入探讨

传统上,将一种药物推向市场需要 10 到 15 年的时间和超过 10 亿美元的资金,而且大多数候选药物都失败了。人工智能攻击了几个瓶颈。在目标识别中,模型挖掘基因组学和蛋白质数据,以找到值得药物治疗的与疾病相关的蛋白质。在热门发现中,生成模型提出具有所需特性的新分子,而虚拟筛选无需实验室合成即可对数百万种化合物进行排名。 DeepMind 的 AlphaFold 预测了超过 2 亿种蛋白质的 3D 结构,为研究人员提供了曾经需要多年晶体学研究的蓝图。 Insilico Medicine 和 Recursion 等公司目前正在人体试验中使用人工智能设计的分子。人工智能还可以及早预测毒性和 ADME(吸收、分布、代谢、排泄),在昂贵的试验之前杀死不良候选者。

技术洞察

分子通常表示为图形(原子作为节点,键作为边缘)并由图形神经网络进行处理,或者作为称为 SMILES 的文本字符串输入序列模型。变分自动编码器和扩散模型等生成方法在学习的化学空间中采样新结构,优化结合亲和力和药物相似性。 AlphaFold 使用在蛋白质数据库上训练的基于注意力的深度学习来预测氨基酸链如何折叠成决定功能的 3D 形状。

掌握药物发现中的人工智能

药物发现中的人工智能利用机器学习来预测分子行为、设计新化合物,并缩短寻找可行药物通常所需的时间和数十亿时间。它正在重塑制药行业最慢、风险最高的部分。药物发现中的人工智能将人工智能应用于特定领域的环境中,在这些环境中,法规、操作和风险承受能力强烈影响设计选择。为了建立深入的理解,请将药物发现中的人工智能视为一种操作模型,而不是单一功能:定义期望的结果,澄清假设,并将系统可以可靠地完成的任务与仍需要专家判断的任务分开。

在实践中,在药物发现中使用人工智能的强大团队将技术能力与领域政策、可审计性和一线决策结合起来。他们记录明确的成功标准,根据实际数据和工作流程进行测试,并根据观察到的失败模式而不是一次性基准测试胜利进行迭代。这就是理论理解转变为跨产品、政策和运营的持久能力的地方。

行业背景决定了人工智能创意能否与现实接触。同时,监管要求可能会使原本强大的原型失效。最具弹性的方法是将实验速度与治理规则结合起来:运行试点、捕获证据、发布决策日志,并随着模型行为、用户期望和监管要求的发展不断更新保障措施。

战略影响

行业背景决定了人工智能创意能否与现实接触。

行业背景决定了人工智能创意能否与现实接触。在高质量部署中,这会转化为可衡量的操作规则、所有权边界和定期审查仪式,以便团队可以增强信心,而不是扩大模糊性。

领域约束会影响可接受的错误率和监督模型。

领域约束会影响可接受的错误率和监督模型。在高质量部署中,这会转化为可衡量的操作规则、所有权边界和定期审查仪式,以便团队可以增强信心,而不是扩大模糊性。

成功的部署使技术能力与一线工作流程保持一致。

成功的部署使技术能力与一线工作流程保持一致。在高质量部署中,这会转化为可衡量的操作规则、所有权边界和定期审查仪式,以便团队可以增强信心,而不是扩大模糊性。

人工智能在药物发现中的未来

前沿是闭环自动驾驶实验室,人工智能提出分子,机器人合成并测试它们,结果在几天内重新训练模型。期望通过实验室反馈、人工智能设计的抗体和 RNA 疗法以及跨生物学训练的基础模型来调整生成化学。监管机构正在为人工智能衍生候选人起草指南。艰难的考验仍然是临床试验,其中生物学的复杂性仍然阻碍着预测,因此人工智能近期最大的胜利是更快、更便宜、更明智的临床前决策。

现实世界的实施

AlphaFold 的开放数据库让世界各地的研究人员能够查找预测的蛋白质 3D 结构,以指导药物设计。

Insilico Medicine 将人工智能发现的一种治疗特发性肺纤维化的药物推进到人体临床试验中。

制药团队使用虚拟筛选对数百万个候选分子进行计算排名,只测试实验室中最有前途的分子。

人工智能毒性模型可以预测候选人是否会损害肝脏或心脏,从而在动物测试之前消除危险化合物。

实施模式

人工智能在药物发现实践中的应用

AlphaFold 的开放数据库让世界各地的研究人员能够查找预测的蛋白质 3D 结构,以指导药物设计。

AlphaFold 的开放数据库让世界各地的研究人员能够查找预测的蛋白质 3D 结构,以指导药物设计。当团队预先定义质量阈值、为边缘情况保留人工升级路径并跟踪一段时间内的生产力增益和错误成本时,通常会获得更好的结果。

人工智能在药物发现实践中的应用

Insilico Medicine 将人工智能发现的一种治疗特发性肺纤维化的药物推进到人体临床试验中。

Insilico Medicine 将人工智能发现的治疗特发性肺纤维化的药物推进到人体临床试验中。当团队预先定义质量阈值、为边缘情况保留人为升级路径并随着时间的推移跟踪生产力增益和错误成本时,通常会获得更好的结果。

人工智能在药物发现实践中的应用

制药团队使用虚拟筛选对数百万个候选分子进行计算排名,只测试实验室中最有前途的分子。

制药团队使用虚拟筛选对数百万个候选分子进行计算排名,只测试实验室中最有前途的分子。当团队预先定义质量阈值、为边缘情况保留人工升级路径并跟踪一段时间内的生产力增益和错误成本时,通常会得到更好的结果。

人工智能在药物发现实践中的应用

人工智能毒性模型可以预测候选人是否会损害肝脏或心脏,从而在动物测试之前消除危险化合物。

AI 毒性模型可以预测候选人是否会损害肝脏或心脏,在动物测试之前消除危险化合物。当团队预先定义质量阈值、为边缘情况保留人为升级路径并跟踪一段时间内的生产力增益和错误成本时,通常会得到更好的结果。

风险与防护栏

!

监管要求可能会使原本强大的原型失效。

!

历史数据可能会编码损害特定社区的偏见。

!

遗留系统可能会造成集成瓶颈和隐性成本。

实施路线图

1

让领域专家参与从问题框架到评估的整个过程。

让领域专家参与从问题框架到评估的整个过程。将每个步骤视为证据门:如果不满足标准,则暂停推出,缩小差距,然后再扩大使用。

2

在启动前设计审计跟踪和文档。

在启动前设计审计跟踪和文档。将每个步骤视为证据门:如果不满足标准,则暂停推出,缩小差距,然后再扩大使用。

3

尽早验证合规性和安全义务。

尽早验证合规性和安全义务。将每个步骤视为证据门:如果不满足标准,则暂停推出,缩小差距,然后再扩大使用。

4

分阶段推出,并具有明确的停止和回滚标准。

分阶段推出,并具有明确的停止和回滚标准。将每个步骤视为证据门:如果不满足标准,则暂停推出,缩小差距,然后再扩大使用。

不断探索