概述
Recursion Pharmaceuticals 运营着世界上最大的自动化生物实验室之一,生成 PB 级的细胞图像,让机器学习模型绘制药物如何改变细胞的图谱。这很重要,因为它将湿实验室生物学转变为人工智能可以在工业规模上搜索的数据问题。
递归制药人工智能在战略、模型访问、平台决策和生态系统合作伙伴关系的背景下得到最好的理解。
深入探讨
Recursion 成立于 2013 年,总部位于盐湖城,围绕“表型组学”制定了战略——拍摄经过数千种化合物和遗传扰动处理的人体细胞的显微镜图像,然后使用深度学习将每张图像转换为数字指纹。具有相似指纹的细胞可能具有相同的生物学特性,因此药物将疾病改变的细胞推回到“健康”状态,成为候选目标。其机器人实验室每周进行数百万次实验,为递归操作系统(现已合并后的 Recursion-Exscientia 公司品牌)提供数据。 2023年,NVIDIA投资了5000万美元,Recursion发布了开放的BioHive超级计算机和RxRx3等大型数据集。该方法将精心挑选的目标换成针对多种疾病的公正的、数据驱动的发现。
技术洞察
递归使用细胞绘画:用荧光染料对细胞进行染色,标记细胞核、线粒体和细胞骨架等细胞器,然后跨通道成像。卷积模型和越来越多的基于变压器的模型将每个图像嵌入到高维向量中。至关重要的是,该团队应用大量批量校正来消除技术伪影(板、日期、仪器),以便生物信号占主导地位。药物根据其嵌入如何将患病细胞转变为健康参考状态来排名。
掌握递归制药人工智能
Recursion Pharmaceuticals 运营着世界上最大的自动化生物实验室之一,生成 PB 级的细胞图像,让机器学习模型绘制药物如何改变细胞的图谱。这很重要,因为它将湿实验室生物学转变为人工智能可以在工业规模上搜索的数据问题。递归制药人工智能在战略、模型访问、平台决策和生态系统合作伙伴关系的背景下得到最好的理解。为了建立深入的理解,请将 Recursion Pharmaceuticals AI 视为一种操作模型,而不是单一功能:定义期望的结果,澄清假设,并将系统可以可靠地执行的操作与仍需要专家判断的操作分开。
在实践中,使用 Recursion Pharmaceuticals AI 的强大团队在做出承诺之前会评估供应商策略、路线图可靠性和锁定风险。他们记录明确的成功标准,根据实际数据和工作流程进行测试,并根据观察到的失败模式而不是一次性基准测试胜利进行迭代。这就是理论理解转变为跨产品、政策和运营的持久能力的地方。
供应商路线图会影响您的团队接下来可以构建的功能。与此同时,发布公告可能会超过实际生产工作流程的稳定性。最具弹性的方法是将实验速度与治理规则结合起来:运行试点、捕获证据、发布决策日志,并随着模型行为、用户期望和监管要求的发展不断更新保障措施。
战略影响
供应商路线图会影响您的团队接下来可以构建的功能。
供应商路线图会影响您的团队接下来可以构建的功能。在高质量部署中,这会转化为可衡量的操作规则、所有权边界和定期审查仪式,以便团队可以增强信心,而不是扩大模糊性。
商业条款和部署选项会影响长期成本和风险。
商业条款和部署选项会影响长期成本和风险。在高质量部署中,这会转化为可衡量的操作规则、所有权边界和定期审查仪式,以便团队可以增强信心,而不是扩大模糊性。
公司激励措施塑造了产品默认、安全态势和开放性。
公司激励措施塑造了产品默认、安全态势和开放性。在高质量部署中,这会转化为可衡量的操作规则、所有权边界和定期审查仪式,以便团队可以增强信心,而不是扩大模糊性。
现实世界的实施
针对脑海绵状血管瘤等罕见遗传疾病模型的细胞筛选数以万计的化合物,将 REC-994 等候选药物推进试验。
使用细胞绘画表型通过发现意想不到的细胞相似性来重新利用现有药物以用于新的适应症。
发布包含数百万张细胞图像的 RxRx3 公共数据集,以便外部研究人员可以训练和基准测试生物学模型。
与罗氏和基因泰克合作,以工业规模绘制神经科学和胃肠道癌症生物学图谱。
实施模式
递归制药人工智能实践
针对脑海绵状血管瘤等罕见遗传疾病模型的细胞筛选数以万计的化合物,将 REC-994 等候选药物推进试验。
筛选数以万计的化合物来对抗脑海绵状血管瘤等罕见遗传疾病的细胞模型,将 REC-994 等候选药物推进试验。当团队预先定义质量阈值、为边缘情况保留人为升级路径并随着时间的推移跟踪生产力增益和错误成本时,通常会获得更好的结果。
递归制药人工智能实践
使用细胞绘画表型通过发现意想不到的细胞相似性来重新利用现有药物以用于新的适应症。
使用细胞绘画表型,通过发现意想不到的细胞相似性,将现有药物重新用于新的适应症。当团队预先定义质量阈值、为边缘情况保留人为升级路径并随着时间的推移跟踪生产力增益和错误成本时,通常会得到更好的结果。
递归制药人工智能实践
发布包含数百万张细胞图像的 RxRx3 公共数据集,以便外部研究人员可以训练和基准测试生物学模型。
发布包含数百万个细胞图像的 RxRx3 公共数据集,以便外部研究人员可以训练和基准化生物学模型。当团队预先定义质量阈值、为边缘情况保留人工升级路径并跟踪随着时间的推移提高生产力和错误成本时,通常会获得更好的结果。
递归制药人工智能实践
与罗氏和基因泰克合作,以工业规模绘制神经科学和胃肠道癌症生物学图谱。
与罗氏和基因泰克合作,在工业规模上绘制神经科学和胃肠道癌症生物学图当团队预先定义质量阈值、为边缘情况保留人工升级路径并随着时间的推移跟踪生产力增益和错误成本时,通常会获得更好的结果。
风险与防护栏
发布公告可能会超过实际生产工作流程的稳定性。
API 定价或政策转变可能会在一夜之间打破假设。
单一供应商依赖性增加了锁定和迁移成本。
实施路线图
使用您自己的任务和数据集评估提供商。
使用您自己的任务和数据集评估提供商。将每个步骤视为证据门:如果不满足标准,则暂停推出,缩小差距,然后再扩大使用。
在集成之前查看隐私、安全和法律条款。
在集成之前查看隐私、安全和法律条款。将每个步骤视为证据门:如果不满足标准,则暂停推出,缩小差距,然后再扩大使用。
维护跨模型或供应商的后备计划。
维护跨模型或供应商的后备计划。将每个步骤视为证据门:如果不满足标准,则暂停推出,缩小差距,然后再扩大使用。
监控发行说明,以便路线图的更改不会让团队感到意外。
监控发行说明,以便路线图的更改不会让团队感到意外。将每个步骤视为证据门:如果不满足标准,则暂停推出,缩小差距,然后再扩大使用。