คู่มืออุตสาหกรรม

AI ในการค้นคว้ายา

AI ในการค้นพบยาใช้การเรียนรู้ของเครื่องเพื่อทำนายพฤติกรรมของโมเลกุล ออกแบบสารประกอบใหม่ และลดจำนวนปีและพันล้านปีที่จำเป็นในการค้นหายาที่มีชีวิต

ภาพรวม

AI ในการค้นพบยาใช้การเรียนรู้ของเครื่องเพื่อทำนายพฤติกรรมของโมเลกุล ออกแบบสารประกอบใหม่ และลดจำนวนปีและพันล้านปีที่จำเป็นในการค้นหายาที่มีชีวิต กำลังปรับเปลี่ยนส่วนที่ช้าที่สุดและเสี่ยงที่สุดของยา

AI ในการค้นพบยาใช้ AI ในสภาพแวดล้อมเฉพาะโดเมน ซึ่งกฎระเบียบ การปฏิบัติงาน และการยอมรับความเสี่ยงเป็นตัวกำหนดทางเลือกในการออกแบบอย่างมาก

เจาะลึก

การนำยาออกสู่ตลาดโดยปกติแล้วจะใช้เวลา 10 ถึง 15 ปีและมีมูลค่ามากกว่าหนึ่งพันล้านดอลลาร์ โดยผู้สมัครส่วนใหญ่ไม่ผ่าน AI โจมตีปัญหาคอขวดหลายประการ ในการระบุเป้าหมาย จำลองข้อมูลจีโนมและโปรตีนเพื่อค้นหาโปรตีนที่เชื่อมโยงกับโรคซึ่งคุ้มค่าแก่การใช้ยา ในการค้นพบที่ได้รับความนิยม แบบจำลองกำเนิดจะเสนอโมเลกุลใหม่ที่มีคุณสมบัติที่ต้องการ ในขณะที่การคัดกรองเสมือนจะจัดอันดับสารประกอบนับล้านที่ไม่มีการสังเคราะห์ในห้องปฏิบัติการ AlphaFold ของ DeepMind คาดการณ์โครงสร้าง 3 มิติของโปรตีนมากกว่า 200 ล้านชนิด ทำให้นักวิจัยสามารถพิมพ์เขียวที่ครั้งหนึ่งเคยต้องใช้เวลาหลายปีในการศึกษาผลึก บริษัทต่างๆ เช่น Insilico Medicine และ Recursion ใช้โมเลกุลที่ออกแบบโดย AI ในการทดลองกับมนุษย์ AI ยังคาดการณ์ความเป็นพิษและ ADME (การดูดซึม การกระจายตัว เมแทบอลิซึม การขับถ่าย) ได้ตั้งแต่เนิ่นๆ ซึ่งจะฆ่าผู้สมัครที่ไม่ดีก่อนการทดลองที่มีค่าใช้จ่ายสูง

ข้อมูลเชิงลึกทางเทคนิค

โมเลกุลมักแสดงเป็นกราฟ (อะตอมเป็นโหนด พันธะเป็นขอบ) และประมวลผลโดยโครงข่ายประสาทเทียมแบบกราฟ หรือเป็นสตริงข้อความที่เรียกว่า SMILES ที่ป้อนเข้ากับแบบจำลองลำดับ วิธีการสร้างเช่นตัวเข้ารหัสอัตโนมัติแบบแปรผันและแบบจำลองการแพร่กระจายเป็นตัวอย่างโครงสร้างใหม่ในพื้นที่เคมีที่เรียนรู้ โดยปรับให้เหมาะสมสำหรับความสัมพันธ์ที่ผูกพันและความคล้ายคลึงกับยา AlphaFold ใช้การเรียนรู้เชิงลึกตามความสนใจที่ได้รับการฝึกอบรมจาก Protein Data Bank เพื่อคาดการณ์ว่าสายกรดอะมิโนจะรวมตัวกันเป็นรูปทรง 3 มิติที่กำหนดฟังก์ชันได้อย่างไร

การเรียนรู้ AI ในการค้นพบยา

AI ในการค้นพบยาใช้การเรียนรู้ของเครื่องเพื่อทำนายพฤติกรรมของโมเลกุล ออกแบบสารประกอบใหม่ และลดจำนวนปีและพันล้านปีที่จำเป็นในการค้นหายาที่มีชีวิต กำลังปรับเปลี่ยนส่วนที่ช้าที่สุดและเสี่ยงที่สุดของยา AI ในการค้นพบยาใช้ AI ในสภาพแวดล้อมเฉพาะโดเมน ซึ่งกฎระเบียบ การปฏิบัติงาน และการยอมรับความเสี่ยงเป็นตัวกำหนดทางเลือกในการออกแบบอย่างมาก เพื่อสร้างความเข้าใจอย่างลึกซึ้ง ให้ถือว่า AI ในการค้นพบยาเป็นเพียงแบบจำลองการดำเนินงาน ไม่ใช่คุณลักษณะเดียว: กำหนดผลลัพธ์ที่ต้องการ ชี้แจงสมมติฐาน และแยกสิ่งที่ระบบสามารถทำได้อย่างน่าเชื่อถือจากสิ่งที่ยังต้องใช้วิจารณญาณจากผู้เชี่ยวชาญ

ในทางปฏิบัติ ทีมที่แข็งแกร่งที่ใช้ AI ในการค้นหายาจะปรับความสามารถทางเทคนิคให้สอดคล้องกับนโยบายโดเมน การตรวจสอบ และการตัดสินใจในแนวหน้า โดยจะบันทึกเกณฑ์ความสำเร็จที่ชัดเจน ทดสอบกับข้อมูลและขั้นตอนการทำงานที่สมจริง และทำซ้ำตามรูปแบบความล้มเหลวที่สังเกตได้ แทนที่จะชนะการวัดประสิทธิภาพเพียงครั้งเดียว นี่คือจุดที่ความเข้าใจทางทฤษฎีกลายเป็นความสามารถที่คงทนของผลิตภัณฑ์ นโยบาย และการดำเนินงาน

บริบททางอุตสาหกรรมเป็นตัวกำหนดว่าแนวคิด AI จะรอดจากการสัมผัสกับความเป็นจริงหรือไม่ ในเวลาเดียวกัน ข้อกำหนดด้านกฎระเบียบอาจทำให้ต้นแบบที่แข็งแกร่งเป็นโมฆะได้ แนวทางที่ยืดหยุ่นที่สุดคือการรวมความเร็วของการทดลองเข้ากับวินัยในการกำกับดูแล: ดำเนินการนำร่อง จับหลักฐาน เผยแพร่บันทึกการตัดสินใจ และอัปเดตการป้องกันอย่างต่อเนื่องเมื่อพฤติกรรมของโมเดล ความคาดหวังของผู้ใช้ และข้อกำหนดด้านกฎระเบียบมีการเปลี่ยนแปลง

ผลกระทบเชิงกลยุทธ์

บริบททางอุตสาหกรรมเป็นตัวกำหนดว่าแนวคิด AI จะรอดจากการสัมผัสกับความเป็นจริงหรือไม่

บริบททางอุตสาหกรรมเป็นตัวกำหนดว่าแนวคิด AI จะรอดจากการสัมผัสกับความเป็นจริงหรือไม่ ในการปรับใช้คุณภาพสูง สิ่งนี้จะถูกแปลเป็นกฎการปฏิบัติงานที่วัดผลได้ ขอบเขตความเป็นเจ้าของ และขั้นตอนการตรวจสอบที่เกิดซ้ำ เพื่อให้ทีมสามารถปรับขนาดความมั่นใจแทนที่จะปรับขนาดความคลุมเครือ

ข้อจำกัดของโดเมนมีอิทธิพลต่ออัตราข้อผิดพลาดที่ยอมรับได้และแบบจำลองการควบคุมดูแล

ข้อจำกัดของโดเมนมีอิทธิพลต่ออัตราข้อผิดพลาดที่ยอมรับได้และแบบจำลองการควบคุมดูแล ในการปรับใช้คุณภาพสูง สิ่งนี้จะถูกแปลเป็นกฎการปฏิบัติงานที่วัดผลได้ ขอบเขตความเป็นเจ้าของ และขั้นตอนการตรวจสอบที่เกิดซ้ำ เพื่อให้ทีมสามารถปรับขนาดความมั่นใจแทนที่จะปรับขนาดความคลุมเครือ

การปรับใช้ที่ประสบความสำเร็จจะปรับความสามารถทางเทคนิคให้สอดคล้องกับเวิร์กโฟลว์แนวหน้า

การปรับใช้ที่ประสบความสำเร็จจะปรับความสามารถทางเทคนิคให้สอดคล้องกับเวิร์กโฟลว์แนวหน้า ในการปรับใช้คุณภาพสูง สิ่งนี้จะถูกแปลเป็นกฎการปฏิบัติงานที่วัดผลได้ ขอบเขตความเป็นเจ้าของ และขั้นตอนการตรวจสอบที่เกิดซ้ำ เพื่อให้ทีมสามารถปรับขนาดความมั่นใจแทนที่จะปรับขนาดความคลุมเครือ

อนาคตของ AI ในการค้นพบยา

ขอบเขตเป็นห้องปฏิบัติการแบบวงปิดที่ขับเคลื่อนด้วยตนเอง โดยที่ AI เสนอโมเลกุล หุ่นยนต์สังเคราะห์และทดสอบพวกมัน และฝึกโมเดลใหม่ภายในไม่กี่วัน คาดหวังเคมีเชิงกำเนิดที่ได้รับการปรับแต่งตามผลตอบรับจากห้องปฏิบัติการ แอนติบอดีที่ออกแบบโดย AI และการบำบัดด้วย RNA และแบบจำลองพื้นฐานที่ได้รับการฝึกอบรมเกี่ยวกับชีววิทยา หน่วยงานกำกับดูแลกำลังร่างคำแนะนำสำหรับผู้สมัครที่ได้รับ AI การทดสอบที่ยากลำบากยังคงเป็นการทดลองทางคลินิก ซึ่งความซับซ้อนของชีววิทยายังคงทำให้การคาดการณ์ลดลง ดังนั้นชัยชนะครั้งใหญ่ที่สุดของ AI ในระยะสั้นจึงเร็วกว่า ถูกกว่า และชาญฉลาดกว่าในการตัดสินใจพรีคลินิก

การใช้งานจริงในโลกแห่งความเป็นจริง

ฐานข้อมูลแบบเปิดของ AlphaFold ช่วยให้นักวิจัยทั่วโลกสามารถค้นหาโครงสร้างโปรตีน 3 มิติที่คาดการณ์ไว้เพื่อเป็นแนวทางในการออกแบบยา

Insilico Medicine พัฒนายาที่ค้นพบโดย AI สำหรับโรคพังผืดในปอดโดยไม่ทราบสาเหตุเข้าสู่การทดลองทางคลินิกในมนุษย์

ทีมเภสัชกรรมใช้การคัดกรองเสมือนจริงเพื่อคำนวณจัดอันดับโมเลกุลที่ต้องการทดสอบนับล้าน โดยทดสอบเฉพาะโมเลกุลที่มีแนวโน้มดีที่สุดในห้องแล็บ

แบบจำลองความเป็นพิษของ AI คาดการณ์ว่าผู้สมัครจะเป็นอันตรายต่อตับหรือหัวใจ โดยกำจัดสารประกอบอันตรายก่อนการทดสอบกับสัตว์

รูปแบบการดำเนินงาน

AI ในการค้นคว้ายาในทางปฏิบัติ

ฐานข้อมูลแบบเปิดของ AlphaFold ช่วยให้นักวิจัยทั่วโลกสามารถค้นหาโครงสร้างโปรตีน 3 มิติที่คาดการณ์ไว้เพื่อเป็นแนวทางในการออกแบบยา

ฐานข้อมูลแบบเปิดของ AlphaFold ช่วยให้นักวิจัยทั่วโลกสามารถค้นหาโครงสร้างโปรตีน 3 มิติที่คาดการณ์ไว้เพื่อเป็นแนวทางในการออกแบบยา ทีมมักจะได้รับผลลัพธ์ที่ดีขึ้นเมื่อพวกเขากำหนดเกณฑ์คุณภาพล่วงหน้า รักษาเส้นทางการยกระดับของมนุษย์สำหรับกรณีขอบ และติดตามทั้งการเพิ่มผลผลิตและต้นทุนข้อผิดพลาดเมื่อเวลาผ่านไป

AI ในการค้นคว้ายาในทางปฏิบัติ

Insilico Medicine พัฒนายาที่ค้นพบโดย AI สำหรับโรคพังผืดในปอดโดยไม่ทราบสาเหตุเข้าสู่การทดลองทางคลินิกในมนุษย์

Insilico Medicine พัฒนายาที่ค้นพบโดย AI สำหรับโรคพังผืดในปอดโดยไม่ทราบสาเหตุในการทดลองทางคลินิกในมนุษย์ ทีมมักจะได้รับผลลัพธ์ที่ดีขึ้นเมื่อพวกเขากำหนดเกณฑ์คุณภาพล่วงหน้า รักษาเส้นทางการยกระดับของมนุษย์สำหรับกรณี Edge และติดตามทั้งการเพิ่มผลผลิตและต้นทุนข้อผิดพลาดเมื่อเวลาผ่านไป

AI ในการค้นคว้ายาในทางปฏิบัติ

ทีมเภสัชกรรมใช้การคัดกรองเสมือนจริงเพื่อคำนวณจัดอันดับโมเลกุลที่ต้องการทดสอบนับล้าน โดยทดสอบเฉพาะโมเลกุลที่มีแนวโน้มดีที่สุดในห้องแล็บ

ทีมเภสัชกรรมใช้การคัดกรองเสมือนจริงเพื่อคำนวณอันดับโมเลกุลของผู้สมัครนับล้าน โดยการทดสอบเฉพาะโมเลกุลที่มีแนวโน้มดีที่สุดในห้องปฏิบัติการ ทีมมักจะได้รับผลลัพธ์ที่ดีกว่าเมื่อพวกเขากำหนดเกณฑ์คุณภาพล่วงหน้า รักษาเส้นทางการยกระดับของมนุษย์สำหรับกรณี Edge และติดตามทั้งประสิทธิภาพการผลิตที่เพิ่มขึ้นและต้นทุนข้อผิดพลาดเมื่อเวลาผ่านไป

AI ในการค้นคว้ายาในทางปฏิบัติ

แบบจำลองความเป็นพิษของ AI คาดการณ์ว่าผู้สมัครจะเป็นอันตรายต่อตับหรือหัวใจ โดยกำจัดสารประกอบอันตรายก่อนการทดสอบกับสัตว์

แบบจำลองความเป็นพิษของ AI คาดการณ์ว่าผู้สมัครจะเป็นอันตรายต่อตับหรือหัวใจ โดยกำจัดสารประกอบอันตรายก่อนที่ทีมทดสอบในสัตว์มักจะได้รับผลลัพธ์ที่ดีกว่าเมื่อพวกเขากำหนดเกณฑ์คุณภาพล่วงหน้า รักษาเส้นทางการยกระดับของมนุษย์สำหรับกรณี Edge และติดตามทั้งการเพิ่มผลผลิตและต้นทุนข้อผิดพลาดเมื่อเวลาผ่านไป

ความเสี่ยงและรั้ว

!

ข้อกำหนดด้านกฎระเบียบอาจทำให้ต้นแบบที่แข็งแกร่งเป็นโมฆะได้

!

ข้อมูลในอดีตอาจเข้ารหัสอคติที่เป็นอันตรายต่อชุมชนบางแห่ง

!

ระบบเดิมสามารถสร้างปัญหาคอขวดในการบูรณาการและต้นทุนแอบแฝงได้

แผนงานการดำเนินงาน

1

ให้ผู้เชี่ยวชาญโดเมนมีส่วนร่วมตั้งแต่การกำหนดกรอบปัญหาไปจนถึงการประเมิน

ให้ผู้เชี่ยวชาญโดเมนมีส่วนร่วมตั้งแต่การกำหนดกรอบปัญหาไปจนถึงการประเมิน ถือว่าแต่ละขั้นตอนเป็นเหมือนประตูหลักฐาน: หากไม่ตรงตามเกณฑ์ ให้หยุดการเปิดตัวชั่วคราว ปิดช่องว่าง จากนั้นจึงขยายการใช้งานเท่านั้น

2

ออกแบบเส้นทางการตรวจสอบและเอกสารประกอบก่อนการเปิดตัว

ออกแบบเส้นทางการตรวจสอบและเอกสารประกอบก่อนการเปิดตัว ถือว่าแต่ละขั้นตอนเป็นเหมือนประตูหลักฐาน: หากไม่ตรงตามเกณฑ์ ให้หยุดการเปิดตัวชั่วคราว ปิดช่องว่าง จากนั้นจึงขยายการใช้งานเท่านั้น

3

ตรวจสอบการปฏิบัติตามข้อกำหนดและภาระผูกพันด้านความปลอดภัยตั้งแต่เนิ่นๆ

ตรวจสอบการปฏิบัติตามข้อกำหนดและภาระผูกพันด้านความปลอดภัยตั้งแต่เนิ่นๆ ถือว่าแต่ละขั้นตอนเป็นเหมือนประตูหลักฐาน: หากไม่ตรงตามเกณฑ์ ให้หยุดการเปิดตัวชั่วคราว ปิดช่องว่าง จากนั้นจึงขยายการใช้งานเท่านั้น

4

เปิดตัวเป็นระยะโดยมีเกณฑ์การหยุดและย้อนกลับที่ชัดเจน

เปิดตัวเป็นระยะโดยมีเกณฑ์การหยุดและย้อนกลับที่ชัดเจน ถือว่าแต่ละขั้นตอนเป็นเหมือนประตูหลักฐาน: หากไม่ตรงตามเกณฑ์ ให้หยุดการเปิดตัวชั่วคราว ปิดช่องว่าง จากนั้นจึงขยายการใช้งานเท่านั้น

สำรวจต่อไป