Rekurencja Pharmaceuticals AI
Recursion Pharmaceuticals prowadzi jedno z największych na świecie zautomatyzowanych laboratoriów biologicznych, generując petabajty obrazów komórkowych, aby umożliwić modelom uczenia maszynowego mapowanie, w jaki sposób leki zmieniają komórki.
Przegląd
It matters because it turns wet-lab biology into a data problem that AI can search at industrial scale.
Głębokie nurkowanie
Założona w 2013 r. firma Recursion z siedzibą w Salt Lake City zbudowała swoją strategię wokół „fenomiki” — wykonywania obrazów mikroskopowych komórek ludzkich poddanych działaniu tysięcy związków chemicznych i zaburzeń genetycznych, a następnie wykorzystując głębokie uczenie się do przekształcania każdego obrazu w numeryczny odcisk palca. Komórki o podobnych odciskach palców prawdopodobnie mają tę samą biologię, więc komórka zmieniona chorobą, którą lek przywraca do stanu „zdrowego”, staje się kandydatem na trafienie. Jej zrobotyzowane laboratoria przeprowadzają co tydzień miliony eksperymentów, zasilając system operacyjny Recursion (obecnie pod marką połączonej firmy Recursion-Exscientia). W 2023 roku NVIDIA zainwestowała 50 milionów dolarów, a firma Recursion wypuściła otwarty superkomputer BioHive i duże zbiory danych, takie jak RxRx3. W tym podejściu ręcznie wybrane cele zostają zastąpione bezstronnymi, opartymi na danych odkryciami dotyczącymi wielu chorób jednocześnie.
Wgląd techniczny
Rekurencja wykorzystuje malowanie komórek: komórki są barwione barwnikami fluorescencyjnymi oznaczającymi organelle, takie jak jądro, mitochondria i cytoszkielet, a następnie obrazowane w różnych kanałach. Modele splotowe i w coraz większym stopniu oparte na transformatorach osadzają każdy obraz w wielowymiarowym wektorze. Co najważniejsze, zespół stosuje intensywną korektę wsadową w celu usunięcia artefaktów technicznych (płytka, dzień, instrument), tak aby dominował sygnał biologiczny. Leki są uszeregowane według sposobu, w jaki ich osadzenie przesuwa chore komórki w kierunku zdrowych stanów referencyjnych.
Wpływ strategiczny
Strategia dostawcy
Plany dostawców wpływają na to, jakie funkcje Twój zespół będzie mógł dalej tworzyć.
Koszt i budżet
Warunki handlowe i opcje wdrożenia wpływają na długoterminowe koszty i ryzyko.
Ryzyko i bezpieczeństwo
Zachęty firmowe kształtują wady produktów, postawę bezpieczeństwa i otwartość.
Przyszłość farmaceutyków rekursyjnych AI
Po połączeniu z Exscientia w 2024 r. firma Recursion łączy swoje mapy fenomenologiczne z projektowaniem chemii opartej na strukturach, mając na celu skrócenie czasu i kosztów odkryć. Spodziewaj się większych modeli podstawowych wyszkolonych na zastrzeżonych mapach biologii i chemii, większej liczby programów partnerskich z firmami Roche, Genentech, Sanofi i Bayer oraz coraz większej kontroli nad tym, czy kandydaci wywodzący się ze sztucznej inteligencji odniosą sukces w badaniach klinicznych na ludziach, co stanowi prawdziwy test platformy.
Implementacja w świecie rzeczywistym
Badanie przesiewowe dziesiątek tysięcy związków pod kątem komórek modelujących rzadkie choroby genetyczne, takie jak malformacje jamiste mózgu, w celu skierowania kandydatów takich jak REC-994 do prób.
Wykorzystanie fenotypów malowania komórek do zmiany przeznaczenia istniejących leków do nowych wskazań poprzez wykrywanie nieoczekiwanych podobieństw komórkowych.
Udostępnienie publicznego zbioru danych RxRx3 zawierającego miliony obrazów komórek, aby zewnętrzni badacze mogli szkolić i porównywać modele biologiczne.
Współpraca z firmami Roche i Genentech w celu mapowania neuronauki i biologii raka przewodu pokarmowego na skalę przemysłową.
Zagrożenia i poręcze
Ogłoszenia o wprowadzeniu na rynek mogą przekroczyć stabilność w rzeczywistych przepływach pracy.
Ceny interfejsów API lub zmiany zasad mogą z dnia na dzień złamać założenia.
Zależność od jednego dostawcy zwiększa koszty uzależnienia i migracji.
Plan wdrożenia
Oceniaj dostawców, korzystając z własnych zadań i zbiorów danych.
Przed integracją przejrzyj warunki dotyczące prywatności, bezpieczeństwa i prawa.
Utrzymuj plan awaryjny dla różnych modeli i dostawców.
Monitoruj informacje o wersji, aby zmiany w planie działania nie zaskoczyły zespołów.
Odkrywaj dalej
Free newsletter
Get the daily AI briefing
Three verified AI stories every weekday morning, written in plain English. Free forever, no ads.
One email each weekday. Unsubscribe in one click. We never sell or share your address.
Test yourself
Take the Recursion Pharmaceuticals AI quiz
Instant feedback on every answer, and a shareable certificate with a verifiable ID once you pass a course.
Support free AI education. AI Understanding is a 501(c)(3) nonprofit — no ads, no paywall, ever. Make a donation
Następny poradnik
Biologia uczenia maszynowego Insitro
Często zadawane pytania
What is Recursion Pharmaceuticals AI?
Recursion Pharmaceuticals prowadzi jedno z największych na świecie zautomatyzowanych laboratoriów biologicznych, generując petabajty obrazów komórkowych, aby umożliwić modelom uczenia maszynowego mapowanie, w jaki sposób leki zmieniają komórki. Ma to znaczenie, ponieważ zmienia biologię w mokrym laboratorium w problem danych, który sztuczna inteligencja może przeszukiwać na skalę przemysłową.
Jakiego podstawowego typu danych używa Recursion do uczenia swoich modeli sztucznej inteligencji?
Podejście rekurencji oparte na „fenomice” koncentruje się na obrazach komórek poddanych działaniu leków lub zmian genetycznych, zamienionych na numeryczne odciski palców.
Na czym polega technika Malowania Komórkowego?
Malowanie komórek wykorzystuje barwniki fluorescencyjne do uwydatniania struktur takich jak jądro i mitochondria, uchwyconych kanałami obrazowania.
Dlaczego Rekurencja stosuje intensywną korektę wsadową swoich danych?
Różnice w płytce, dniu lub instrumencie mogą zakłócić prawdziwą biologię, dlatego korekcja wsadowa izoluje prawdziwy sygnał biologiczny.
Która firma zainwestowała 50 milionów dolarów w Recursion w 2023 roku?
NVIDIA zainwestowała 50 milionów dolarów w 2023 roku, co odzwierciedla intensywny charakter GPU opartej na obrazach sztucznej inteligencji firmy Recursion.
Z jaką firmą zajmującą się odkrywaniem leków wykorzystującą sztuczną inteligencję firma Recursion połączyła się w 2024 r.?
Projekt Recursion połączył się z Exscientia, łącząc fenomenologię z projektowaniem chemii opartej na strukturach.